যদিও প্রকৃত সময় জানা যায় না, তবুও মনে করা হয়, প্রায় ৫০০ বছর আগে থেকেই এ পুজোর প্রচলন রয়েছে। মুর্শিদাবাদের রঘুনাথগঞ্জ থানার গদাপুর গ্রামে এই মা পূজিত হন। তবে এই পুজোর পিছনে রয়েছে অনেক পুরনো রহস্যময়ী ইতিহাস।
বলা হয় , প্রায় ৫০০ বছর আগে দুর্গা পুজোর সময় হঠাৎ ই গদাইপুর গ্রামের পুরোহিতের কণ্যা নিখোঁজ হয়ে যায়। এদিক -ওদিক খোঁজাখুঁজির পর তাকে পাওয়া যায় মায়ের পেটে। সেই থেকেই এই দুর্গাপুজো জাগ্রত হয় 'পেটকাটি দুর্গা' বলে। এই গল্পের সত্যতার পিছনে না গিয়ে যদি এর জনপ্রিয়তার দিকে যাওয়া যায়, তবে বলতেই হয় 'পেটকাটি দুর্গা ' খুবই জনপ্রিয়।